Estudios previos han evidenciado una asociación entre la circulación del virus respiratorio sincitial (vrs) y la enfermedad neumocócica invasiva (eni), posiblemente mediada por mecanismos de interacción virus-bacteria. El objetivo fue describir la epidemiología de la eni en menores de 3 años antes y después de la introducción de la inmunoprofilaxis frente a vrs.

Estudio descriptivo retrospectivo de casos de eni confirmados microbiológicamente en menores de 3 años, a partir de un laboratorio de referencia con cobertura poblacional. Se definieron 2 periodos: pre-profilaxis (octubre 2021-septiembre 2023) y post-profilaxis (octubre 2023-septiembre 2025). Se describió la distribución por edad y por temporada, y la proporción de casos de eni ocurridos durante la circulación de vrs, definida entre las semanas epidemiológicas 40 y 12 de cada temporada.

Se incluyeron 62 casos de eni, ocurriendo el 50% en cada periodo.  La proporción de casos en menores de 1 año fue inferior en el periodo post-profilaxis respecto al pre-profilaxis (22,6% vs. 32,3%). Los casos de eni se concentraron progresivamente durante la circulación de vrs (36,4% del total en 2021–2022; 60,0% en 2022–2023; 73,9% en 2023–2024; 100,0% en 2024–2025).

Tras la introducción de la inmunoprofilaxis frente a vrs, la eni en menores de 3 años mostró una menor proporción de casos en lactantes y una mayor concentración temporal coincidente con la circulación viral. Estos hallazgos son compatibles con una posible interacción viral-bacteriana. No obstante, el diseño descriptivo y la posible influencia de factores de confusión, como cambios en la vacunación neumocócica, limitan la inferencia causal.