Las infecciones respiratorias agudas (IRA) son una causa frecuente de atención sanitaria en menores de cinco años y pueden requerir atención primaria, urgencias o hospitalización. Sin embargo, la información sobre su etiología viral en estos primeros ámbitos es limitada. El objetivo fue describir la distribución viral y el perfil clínico, con especial atención a gripe, metapneumovirus humano (hMPV) y virus respiratorio sincitial (VRS).

Se analizaron datos prospectivos recogidos entre el 28 de noviembre de 2024 y el 28 de noviembre de 2025 en un área sanitaria con 281.000 habitantes. Se incluyeron menores de cinco años con al menos un síntoma respiratorio agudo en los diez días previos (fiebre, tos, dificultad respiratoria, anosmia, ageusia o disgeusia). Se obtuvieron muestras nasofaríngeas y nasales de todos los hospitalizados y de hasta seis por semana en urgencias y atención primaria. La identificación viral se realizó mediante técnica molecular multiplex. Se estimaron frecuencia, distribución viral y síntomas según nivel asistencial.

Se identificaron 44 casos de gripe, 54 de VRS y 38 de hMPV. La mayoría se detectaron en urgencias (50,0%, 46,3% y 52,6%, respectivamente). La gripe se observó en 2 hospitalizaciones (4,5%), 22 urgencias (50,0%) y 20 en atención primaria (45,5%); el VRS en 7 (13,0%), 25 (46,3%) y 22 (40,7%); y el hMPV en 8 (21,1%), 20 (52,6%) y 10 (26,3%). La fiebre fue más frecuente en gripe (97,7%) y hMPV (89,5%), mientras que la tos y la dificultad respiratoria fueron más frecuentes en VRS (94,4% y 64,8%) y hMPV (92,1% y 68,4%).

Las diferencias sugieren variabilidad clínica según etiología viral, aunque el solapamiento de los síntomas dificulta la identificación viral solo clínica.

La vigilancia con confirmación microbiológica permite caracterizar la circulación viral, resaltando la necesidad de estrategias diagnósticas y preventivas en población pediátrica.