Analizar las causas de la reemergencia del serotipo 3 y la posible contribución de la gripe A/H1N1, A/H3N2 y B en su evolución.

En este estudio se han realizado análisis genómicos de aislados de neumococo pediátricos y adultos de serotipo 3 durante 2008-2023 para estudiar linajes circulantes y factores de virulencia. Se han realizado análisis de series temporales (GLS y ARIMAX) entre casos de distintos tipos de gripe y de ENI del serotipo 3. Por último, se han realizado ensayos de patogenicidad para evaluar las coinfecciones gripe-neumococo serotipo 3.

Tras la introducción de la VCN-13, los aislados del Clado I-α/ST180/CC180/GPSC12 comenzaron a ser los predominantes y a desplazar aquellos del linaje ST260/CC260/GPSC83 con el que co-circulaba antes de la vacuna. Las cepas del Clado I-α presentan una mutación en LytA que les permite evadir mejor la opsonofagocitosis. Además, los casos por gripe A/H3N2 y en menor medida de gripe B, parecen explicar en parte la evolución de este serotipo, con una asociación significativa entre estos tipos de gripe y los neumococos de serotipo 3. En coinfecciones in vitro, la presencia del virus A/H3N2 es la que más incrementa la adhesión al epitelio por neumococo de serotipo 3, seguido de la gripe B. Por el contrario, no se observan diferencias significativas entre gripe A/H1N1 y el serotipo 3 de neumococo.

La VCN-13 consiguió reducir los casos de ENI en los primeros años tras su implementación. A partir de 2016, los casos por serotipo 3 aumentaron gracias al aumento del Clado I-α que presentaba una mayor capacidad para evadir el sistema inmune gracias a la mutación en LytA. La gripe A/H3N2 también parece explicar en parte la evolución creciente de este serotipo.